Ohne Software kein High Performance Computing, AI oder Cloud Computing! Moderne HPC-Systeme unterscheiden sich deutlich von Computern aus dem Consumer-Bereich hinsichtlich ihrer Architektur (z. B. Art und Anzahl der Rechenkerne, Größe des Arbeitsspeichers), der Speichermedien und vor allem der meist komplexen Netzwerktopologie. Daher kommen auf die HPC-Systeme angepasste Betriebssysteme zum Einsatz. Auf deren Grundlage wird den Nutzer/innen ein breites Software-Portfolio bereitgestellt. Das umfasst einerseits auf das HPC-System abgestimmte Basis-Software wie z. B. Compiler oder Kommunikationsbibliotheken für paralleles Rechnen, und andererseits die HPC-Anwendungen wie z. B. Simulationssoftware und wissenschaftliche Bibliotheken. Das Software-Angebot steht den Nutzer/innen üblicherweise über ein Modulsystem zur Verfügung. Software-Komponenten in den gewünschten Versionen können zusammengestellt und in Rechenjobs eingesetzt werden. 

Das Angebot umfasst neben Open-Source-Paketen und Community-Anwendungen auch kommerzielle Software. Darüber hinaus steht es den Nutzer/innen frei, Software-Pakete oder selbst-entwickelte Programme in ihr privates Verzeichnis zu installieren. Auf Wunsch kann Software auch in das Portfolio aufgenommen oder auch Unterstützung bei der Installation und Konfiguration auf dem HPC-System geleistet werden.

Erklärungen und Beispiele zu Software sind nachfolgend aufgeführt.

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